Письмо Минфина России от 06.12.2016 № 03-11-12/72628

ПСН может применяться индивидуальными
предпринимателями, осуществляющими предпринимательскую деятельность в сфере оказания услуг по техническому обслуживанию и ремонту автотранспортных и мототранспортных средств, машин и оборудования. К услугам по техническому обслуживанию и ремонту автотранспортных средств относятся в том числе услуги по ремонту электрооборудования легковых автомобилей и
лёгких грузовых автотранспортных средств. В отношении предпринимательской деятельности по оказанию услуг по чип-тюнингу автомобиля (изменению программы управления блока двигателя автотранспортного средства) ИП вправе применять ПСН.

Чип-тюнинг способен повысить мощность двигателей, крутящий момент и значительно уменьшить расходы топлива. Это делается без механического вмешательства и безо всякого вреда автомобилю. Улучшение происходит за счёт изменений в настройках и оптимизации заводских установок, которые влияют на системы управление АКПП и двигателем автомобиля.

Оборудование для чип-тюнинга позволяет внести изменения только в программную часть автомобильного бортового компьютера, не касаясь конструкции двигателя, системы впрыска топлива или выхлопа.
Такая услуга вполне приемлема для ПСН.