Письмо Минфина России от 20.04.2016 № 03-11-06/2/25405

Объектом налогообложения по НДС являются операции по реализации товаров (работ, услуг) на территории РФ, а также передача имущественных прав. Перечни операций, не признаваемых объектом налогообложения и не подлежащих налогообложению (освобождаемых от налогообложения) установлены Налоговым кодексом РФ. Не признаётся объектом налогообложения по НДС передача имущества некоммерческим организациям на осуществление ими основной уставной деятельности, не связанной с предпринимательством.

Если имущество предназначено для использования одновременно как в основной уставной, так и в предпринимательской деятельности, передающая сторона должна начислить НДС.

У некоммерческой организации, применяющей УСН и передающей нежилое помещение в собственность религиозной организации, объектов налогообложения по НДС и налогу на прибыль не возникает.

При оказании услуг по предоставлению в аренду имущества религиозного назначения и иной недвижимости организацией, применяющей общую систему налогообложения, данные операции облагаются НДС.

При определении налоговой базы по налогу на прибыль не учитываются целевые поступления на содержание некоммерческих организаций и ведение ими уставной деятельности, поступившие безвозмездно от других организаций и (или) физических лиц и использованные указанными получателями по назначению. При этом налогоплательщики - получатели указанных целевых поступлений обязаны вести раздельный учёт доходов (расходов), полученных (понесённых) в рамках целевых поступлений. К таким целевым поступлениям, в частности, относятся имущество (включая денежные средства) и (или) имущественные права, которые получены религиозными организациями на осуществление уставной деятельности.